コントロールで超越は倒せないのか？

無理ですね
仮に超越を狩れるコントロールとか出来ても
それは本当にコントロールと呼べるのか？って感じです

まあ超越側有利なのはそうですがマッチング時点で詰んでる人はいないと思います。ようはどっちがブン回るかです。
コンロやコンネクは守護並べまくれば超越は攻めあぐねますし、エイラも超越完成前にフォロワーをムキムキにしてしまえばお手上げです。
昆布も序盤はアグロヴァンプの動きで削って終盤はメアコンでリーサル取れますし。
冥府エルフもリノ、リザで引き倒したり

コントロールでメタるのは難しいかと。

そもそもコントロールメタの超越がコントロールにヤられては本末転倒。

ただ、そもそも事故りやすいデッキなので対策は出来なくもないです。

戦術的には、こちらは極力フォロワーを盤面に残さず出てきた相手のフォロワーを上手く処理して9ターン前後にフィニッシュ出来る能力のあるデッキなら勝利も可能。

ヴァンプなら8ターン目にアザゼルから９ターン目にメアリー、鋭利×２。

どちらにしても余程回りが良くないと超越にはかてないと思います。

コンロをずっと使っていますが、超越相手には分が悪いので２～３割程しか勝てません。（相手の事故を除く）
疾走持ち（ノーヴィスト、アルベール、アルビダ）の序盤から進化を使って７ターンくらいまでに決めるのが良いのかと思います。

適材適所です。
そもそも超越がコントロールをメタっているので、勝ちづらいのは当然のことです。
そもそもコントロールで倒したいのはフォロワーを展開するタイプのデッキで、
テンポウィッチやアグロヴァンプなど相手には軒並み戦績良いです。（シャドウバース対戦ログより）
さらに、そのアグロ系には超越は勝ちづらいですよ。
軽々しく未来などあるのかなど言うべきではないでしょう。

ロイヤルならアルビダとアルベールで10点削って、凌ぎおじで凌いで、9ターン目アルベールで10点殴って勝ち